索县内部的行政区划曾经历过多次调整。最近的两次调整是1988年的撤区并乡和2002年的个别乡镇合并。2002年至今，全县共有10个乡镇。

　　撤区并乡前，索县共设有五个区公所，下辖26个乡（公社），具体是：

　　（一）索巴区：下辖亚拉、永纳、永路、亚堂４个乡；

　　（二）荣布区：下辖热都、巴格、则荣、热布、色昌（西昌）、嘎木６个乡；

　　（三）军巴区：下辖加勤、依巴、雪松、尺如、多瓦、索堆、嘎都、嘎美8个乡；

　　（四）宁巴区：下辖亚安、热瓦、查巴、若达４个乡；

　　（五）江达区：下辖开登、江达、永珠、永巴４个乡。

　　根据藏党发〔87〕41号文件精神，1988年索县开展了撤区并乡工作。撤区并乡后，全县共下辖12个乡镇，分别是：亚拉镇、永纳乡、亚安乡、热瓦乡、若达乡、嘎美乡、加勤乡、荣布乡（2001年后为荣布镇）、西昌乡、嘎木乡、江达乡、赤多乡。

　　2002年，索县的个别乡镇进行了合并，永纳乡和亚安乡全部并入亚拉镇。此后至今，全县共下辖亚拉镇、热瓦乡、若达乡、嘎美乡、加勤乡、荣布镇、西昌（色昌）乡、嘎木乡、江达乡、赤多乡等10个乡镇。